RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDELR2P33947 212 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 APLNRP35414 380 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB1P43366 347 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSCR9P59020 149 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00205P59089 165 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 VLDLRP98155 873 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPIBQ01892 262 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAM2Q15035 370 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGCAQ16586 387 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC36A2Q495M3 483 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFI44LQ53G44 452 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 COQ5Q5HYK3 327 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 AVPI1Q5T686 147 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 AWAT2Q6E213 333 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM166AQ6J272 317 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP37Q8NFH4 326 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6S1Q8NH40 331 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6X1Q8NH79 312 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FANK1Q8TC84 345 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LZICQ8WZA0 190 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 NABP1Q96AH0 204 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q96M85 177 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3GL1Q99961 368 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FN3KQ9H479 309 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED4Q9NPJ6 270 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TREM2Q9NZC2 230 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNS2Q9ULS6 477 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMAHPQ9Y471 501 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG2Q9Y698 323 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBN3Q75N90 2809 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WUU8 490 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM129A0AVI4 362 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISPDA4D126 451 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf49A4QMS7 147 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FFAR1O14842 300 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARPC2O15144 300 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYNGR3O43761 229 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGRN1O60291 552 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMX1BO60663 402 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAMBPO95630 424 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R3DO95685 299 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHMP01871 453 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV2-30P06310 120 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF35P13682 527 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF23P17027 643 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAP3P28838 519 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA8P32881 189 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPV17P39210 176 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 WNT5AP41221 380 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR5AP47898 357 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSME3P61289 254 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNGT1P63211 74 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOWP63302 87 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL8P80075 99 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST3GAL3Q11203 375 aa3.74□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZP4Q12836 540 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms