RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 OR52W1Q6IF63 320 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZSR3 168 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 COMMD1Q8N668 190 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR6X1Q8NH79 312 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BIN3Q9NQY0 253 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MLXQ9UH92 298 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.93□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 METTL12A8MUP2 240 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LMX1BO60663 402 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IFNA4P05014 189 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM157CP0CG43 387 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PRKACAP17612 351 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 THBS4P35443 961 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RFC3P40938 356 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF84P51523 738 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IL15RAQ13261 267 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FAM122AQ96E09 287 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GAL3ST1Q99999 423 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.92□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 F8W036 122 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 APOC1P02654 83 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PMP2P02689 132 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PGA4P0DJD7 388 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PGA3P0DJD8 388 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LTBRP36941 435 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CAV2P51636 162 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CLRN1P58418 232 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GABREP78334 506 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ECH1Q13011 328 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GUCA2BQ16661 112 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 POC1AQ8NBT0 407 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM230Q96A57 120 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CMBLQ96DG6 245 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR10A2Q9H208 303 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ZFP57Q9NU63 452 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.91□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 GMFGO60234 142 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ABOP16442 354 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 AMY2BP19961 511 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ADH6P28332 368 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 EFNA3P52797 238 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 CTAG1AP78358 180 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TSC22D1Q15714 1073 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PP6455Q8WZ26 134 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 PMEPA1Q969W9 287 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 ARL5BQ96KC2 179 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TM2D1Q9BX74 207 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0U1RQV5 110 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 SHISA7A6NL88 538 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 MPIG6BO95866 241 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 IGLV3-1P01715 115 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 LIPCP11150 499 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NAT2P11245 290 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FOLR2P14207 255 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 OR3A2P47893 321 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 NXPH1P58417 271 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 FOXF1Q12946 379 aa14.9□□□□□ -0.02
HCLS1-202ENST00000428394 HIST3H3Q16695 136 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms