RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF823P16415 610 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU4F2Q12837 409 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCK2Q16822 640 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LNX2Q8N448 690 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPRL2Q8WTW4 380 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPA3Q9H6K4 179 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRT7Q9NRC8 400 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf119Q9NWQ9 140 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ONECUT1Q9UBC0 465 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4Q9UBX2 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDH3BO43837 385 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN9O75954 239 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSF1P09603 554 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT2P50583 147 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPIBQ01892 262 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGR3Q06889 387 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR38Q5JTN6 314 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYATQ6IB77 296 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROKR2Q8NFJ6 384 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC29Q8WV35 223 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL13Q99616 98 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COPS4Q9BT78 406 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADA2Q9NZK5 511 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAH3Q8TD57 4116 aa10.82□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TVP23AA6NH52 213 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XRCC2O43543 280 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GADD45GO95257 159 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A1P11166 492 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSKH1P11801 424 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYCR1P32322 319 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRK5P34947 590 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBR2P37173 567 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM11AP58511 58 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MICBQ29980 383 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCXRQ7Z4W1 244 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR86Q86TI4 376 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf53Q8IXP5 236 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMTM4Q8IZR5 234 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8S1Q8NH09 359 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 V9GYQ6 96 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPFFO15130 113 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMG1P04279 462 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDOSTP39656 456 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSSP48637 474 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKXP51817 358 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT4Q8N4A0 578 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1M1Q8NGA1 313 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T4Q8NH00 348 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5R1Q8NH85 324 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPSB4Q96A44 273 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ15Q99712 375 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa10.81□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACOT8O14734 319 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFB3O43676 98 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCTN3O75935 186 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAHP00439 452 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPARCP09486 303 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNGR2P38484 337 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLX1P56177 255 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSME3P61289 254 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK2BP67870 215 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN31Q12999 210 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRD1Q13241 179 aa10.8□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKZF1Q13422 519 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms