RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM81AQ8TBF8 368 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 LYZL4Q96KX0 146 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 APOL4Q9BPW4 351 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TTTY10Q9BZA0 68 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 UFSP2Q9NUQ7 469 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM206AQ9NX38 181 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IMPAD1Q9NX62 359 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IKZF2Q9UKS7 526 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PHYHO14832 338 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM157CP0CG43 387 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF2P14316 349 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RIDAP52758 137 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MZT1Q08AG7 82 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMED1Q13445 227 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf87Q8N0U7 546 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SPICQ8N5J4 248 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR11L1Q8NGX0 322 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8TCH9 128 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 STMN2Q93045 179 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RFKQ969G6 155 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM165Q9HC07 324 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NAV3Q8IVL0 2385 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV20A0A0B4J274 112 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GRPP07492 148 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 HNF1AP20823 631 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PCMT1P22061 227 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V1E1P36543 226 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MDH2P40926 338 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 POU4F2Q12837 409 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8S1Q8NH09 359 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R14AQ96A00 147 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MBOAT4Q96T53 435 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PBOV1Q9GZY1 135 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF391Q9UJN7 358 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIAL4DF5H284 164 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM20BO75063 409 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T7P0C7T2 308 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 EGR3Q06889 387 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8B8Q15620 311 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SNCBQ16143 134 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A30Q5SVS4 291 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM201AQ5SY85 155 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T27Q8NH04 317 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FAHD2AQ96GK7 314 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX5Q99593 518 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa17.72■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SVEP1Q4LDE5 3571 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0U1RQV5 110 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD6O75354 484 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 APOL3O95236 402 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 FSTL3O95633 263 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PNPP00491 289 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNA2P01563 188 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SRD5A1P18405 259 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ACKR3P25106 362 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GNALP38405 381 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF7Q9UBF6 113 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GMPPBQ9Y5P6 360 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 DYSFO75923 2080 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4-204ENST00000416021 JMJD1CQ15652 2540 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CST4P01036 141 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT2P09544 360 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LCN2P80188 198 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OCLNQ16625 522 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MEDAGQ5VYS4 303 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 SSX6Q7RTT6 188 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 FTMTQ8N4E7 242 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 G6PC2Q9NQR9 355 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf123Q9NWV4 160 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MPC1Q9Y5U8 109 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF850A8MQ14 1090 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CEACAM18A8MTB9 384 aa17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms