RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MED4Q9NPJ6 270 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATAD5Q96QE3 1844 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KMT2AQ03164 3969 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PNPLA6Q8IY17 1366 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZANQ9Y493 2812 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A8MWP4 228 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 H3BMM0 161 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 M0R1X1 148 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRAPPC3O43617 180 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SSX5O60225 188 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KINO60870 393 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KITLGP21583 273 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LAP3P28838 519 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GRIA1P42261 906 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RGS6P49758 472 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TAS2R46P59540 309 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPX6P59796 221 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARF5P84085 180 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF33AQ06730 810 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPA4Q13156 261 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCL15Q16663 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MLIPQ5VWP3 458 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNSTQ6PJW8 725 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OPN5Q6U736 354 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC80Q76M96 950 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OLIG3Q7RTU3 272 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C10orf53Q8N6V4 93 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ENKURQ8TC29 256 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DCAKDQ8WVC6 231 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UBE2WQ96B02 151 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DERL3Q96Q80 235 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OMDQ99983 421 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ADPGKQ9BRR6 497 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FICDQ9BVA6 458 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPA2Q9H2U2 334 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ING4Q9UNL4 249 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNTNAP1P78357 1384 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DISP1Q96F81 1524 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A0J9YYE9 177 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRRG1O14668 218 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TP53I11O14683 189 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHADO15335 359 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLHL41O60662 606 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FKBP6O75344 327 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRBC1P01850 177 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FGGP02679 453 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTLA4P16410 223 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GGT1P19440 569 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MUTP22033 750 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PAX6P26367 422 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPP1CAP62136 330 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATP5G2Q06055 141 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MESDQ14696 234 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR7A5Q15622 319 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC36A3Q495N2 470 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPINK6Q6UWN8 80 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RTL4Q6ZR62 310 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q6ZTI0 123 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDPNQ86YL7 162 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RXFP4Q8TDU9 374 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CXorf40AQ8TE69 158 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OSTF1Q92882 214 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TNFRSF14Q92956 283 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMBIM1Q969X1 311 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms