RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 WDR54Q9H977 334 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACER3Q9NUN7 267 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-1.74□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-1.74□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARHGEF10O15013 1369 aa-1.74□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 RGPD5Q99666 1765 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 NCOA2Q15596 1464 aa-1.75□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 OSTF1Q92882 214 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 APH1AQ96BI3 265 aa-1.75□□□□□ -2.69
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RNU6-540P-201ENST00000384622 AKR1E2Q96JD6 320 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 CNDP1Q96KN2 507 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 GPR21Q99679 349 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCL19Q99731 98 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 C1orf50Q9BV19 199 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 EDEM2Q9BV94 578 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 OSBPL8Q9BZF1 889 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR2H1Q9GZK4 316 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 BPESC1Q9GZL8 116 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 ABCG4Q9H172 646 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-540P-201ENST00000384622 ABCG5Q9H222 651 aa-1.75□□□□□ -2.69
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