RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 AMTP48728 403 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 VAMP7P51809 220 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE7AQ13946 482 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 D2HGDHQ8N465 521 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX22Q96L94 193 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 UBQLN3Q9H347 655 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EPK0 472 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 BNIP3LO60238 219 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MPZL1O95297 269 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 WNT2P09544 360 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LYL1P12980 280 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MPGP29372 298 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 EFNB3Q15768 340 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 STEAP4Q687X5 459 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZTK2 550 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 Q7L0L9 218 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FRZBQ92765 325 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GINS3Q9BRX5 216 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR27A2RRH5 827 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL5CA6NH57 179 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC119BA6NIH7 251 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF785A8K8V0 405 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMPRSS2O15393 492 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 KNG1P01042 644 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FAHD1Q6P587 224 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10C1Q96KK4 312 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MCEEQ96PE7 176 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBP1Q9H171 429 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WX48 190 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0U1RRA0 63 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5B21A6NL26 309 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CASKO14936 926 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF12O43508 249 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CD14P08571 375 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF28P17035 718 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NME2P22392 152 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 AVPR1BP47901 424 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SULT1A1P50225 295 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LILRA4P59901 499 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MORN2Q502X0 79 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX26Q8N6G2 289 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LMLNQ96KR4 655 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DPH1Q9BZG8 443 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 IL36AQ9UHA7 158 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6C6A6NF89 314 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GLOD5A6NK44 160 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LIPT2A6NK58 231 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 F5H5K5 113 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SYT7O43581 403 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CNMDO75829 334 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF15O95150 251 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CELA3AP09093 270 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL1P09341 107 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 IDSP22304 550 aa6.04□□□□□ -1.44
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