RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BMM0 161 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL41O60662 606 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TGM6O95932 706 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1D-33P01593 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1-33P01594 117 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSMCR30P0CW71 290 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 KITLGP21583 273 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTR2AP28223 471 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRIA1P42261 906 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS6P49758 472 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFA8P51970 172 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1CAP62136 330 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF8Q02556 426 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF33AQ06730 810 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR7A5Q15622 319 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPIN4Q56A73 249 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNSTQ6PJW8 725 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRINAQ7Z429 371 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDPNQ86YL7 162 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM71AQ8IYT1 594 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2A1Q8NGT9 310 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RXFP4Q8TDU9 374 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf40AQ8TE69 158 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2WQ96B02 151 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 YIPF6Q96EC8 236 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHA8Q96JA3 519 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CABS1Q96KC9 395 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 NMRAL1Q9HBL8 299 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP50Q9UKX7 468 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLUHO75153 1309 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 A8MUN3 132 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 F8VP50 259 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYNC1I1O14576 645 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TP53I11O14683 189 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G10O15496 165 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 NMT2O60551 498 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 EEDO75530 441 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPIND1P05546 499 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 ETS1P14921 441 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJB1P25685 340 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR7P32248 378 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 CA8P35219 290 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR4P46093 362 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSR4P51571 173 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP5G2Q06055 141 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDK1Q15118 436 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2orf76Q3KRA6 126 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZSR6 202 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZIC4Q8N9L1 334 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4M2Q8NGB6 313 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCAKDQ8WVC6 231 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 THRSPQ92748 146 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM230Q96A57 120 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKNOX2Q96KN3 472 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 DERL3Q96Q80 235 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 RDH14Q9HBH5 336 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIPOXQ9P0Z9 390 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 VAX2Q9UIW0 290 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 MUC2Q02817 5179 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0J9YYE9 177 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PPV9 198 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM72A0PK05 275 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 XKRY2A2RUG3 117 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 A8MWP4 228 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 H7C1H1 209 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC7O00311 574 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R2P9O14990 202 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 FKBP6O75344 327 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLPXO76031 633 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBC1P01850 177 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms