RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CAV3P56539 151 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIBQ01892 262 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PCK2Q16822 640 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N7P7 452 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 RORBQ92753 470 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF14Q92956 283 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5M11Q96RB7 305 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT4Q9H2B2 425 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF19Q9Y242 345 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.38□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE6AA0A183 80 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 VGLL3A8MV65 326 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R135 149 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT8O14734 319 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 XRCC2O43543 280 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNGR1O43759 233 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DQA2P01906 255 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SCG5P05408 212 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRM2P08172 466 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TGM4P49221 684 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 OR12D2P58182 307 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-11P60412 298 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVFRD-1P60508 538 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 POU4F2Q12837 409 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAM2Q15035 370 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF13Q15543 124 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 VMACQ2NL98 169 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED5Q49AG3 693 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 DRAM2Q6UX65 266 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MICU2Q8IYU8 434 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PNKDQ8N490 385 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SVOPQ8N4V2 548 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TAMM41Q96BW9 452 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MALSU1Q96EH3 234 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF799Q96GE5 643 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRC1Q96M27 445 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 Q96M85 177 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MICU1Q9BPX6 476 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC13Q9H3R2 512 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB9Q9NP78 766 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP12Q9Y561 859 aa6.37□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST1O43916 411 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB2O95178 105 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 RENP00797 406 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF823P16415 610 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPZA1P52907 286 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H3AP68431 136 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 IL5RAQ01344 420 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCDQ05655 676 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MPP2Q14168 576 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 AGKQ53H12 422 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MESTQ5EB52 335 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 MAVSQ7Z434 540 aa6.36□□□□□ -1.39
PGGT1B-201ENST00000296642 NRMQ8IXM6 262 aa6.36□□□□□ -1.39
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