RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD4CQ8TF44 421 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SOX7Q9BT81 388 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ABCD4O14678 606 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RAB13P51153 203 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SCAND1P57086 179 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PPIAP62937 165 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RTL8BQ17RB0 113 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT9Q9BW91 350 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 IL2RAP01589 272 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 EDARADDQ8WWZ3 215 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LIMS3P0CW19 117 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 LIMS4P0CW20 117 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SPEM1Q8N4L4 309 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC22Q8N966 263 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB44Q8NCP5 570 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CHST6Q9GZX3 395 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF90Q03938 601 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf87Q6NUJ2 197 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG3Q86Y34 549 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A6Q8IZM9 456 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SPSB1Q96BD6 273 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PELI1Q96FA3 418 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PSENENQ9NZ42 101 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 C1QAP02745 245 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT1P15291 398 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 H3F3AP84243 136 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF683Q8IZ20 524 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 HGDQ93099 445 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TIMD4Q96H15 378 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 METTL12A8MUP2 240 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS44E7EML9 344 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 GUCA2AQ02747 115 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OTPQ5XKR4 325 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF321PQ8N8H1 164 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR2V1Q8NHB1 315 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FGF14Q92915 247 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 PROCRQ9UNN8 238 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A10P0DMU9 189 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 FAHP16930 419 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR2W3Q7Z3T1 314 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 CABLES2Q9BTV7 478 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 IGHA2P01877 340 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR4S1Q8NGB4 309 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TGIF2Q9GZN2 237 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 OR51I2Q9H344 312 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 AQP7O14520 342 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF11O14788 317 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM7Q9BQ49 75 aa19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF718Q3SXZ3 478 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 OR2B11Q5JQS5 317 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 UQCC3Q6UW78 93 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF561Q8N587 486 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 UQCC2Q9BRT2 126 aa19.02■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CSN1S1P47710 185 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP2Q05923 314 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SSX1Q16384 188 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD16Q6P6B7 361 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DEGS2Q6QHC5 323 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 BTLAQ7Z6A9 289 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 GPR119Q8TDV5 335 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC74BQ96LY2 380 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS9Q9BPW9 319 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC61Q9BV99 259 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD1Q8N668 190 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PCED1AQ9H1Q7 454 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 LOXL2Q9Y4K0 774 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 AQP8O94778 261 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PLA1AQ53H76 456 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR6Q96RI8 345 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 F5P12259 2224 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 PRRG2O14669 202 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 IAPPP10997 89 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 FPR2P25090 351 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 RXFP4Q8TDU9 374 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A7Q92504 469 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 MTFP1Q9UDX5 166 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa19.01■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01387J3KSC0 135 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf58P58505 322 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf45Q96LM5 186 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-201ENST00000284617 ZPBPQ9BS86 351 aa19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms