RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SVIL	O95425	2214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	DNPH1	O43598	174 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	HRG	P04196	525 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CRABP1	P29762	137 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RP2	O75695	350 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	VAMP5	O95183	116 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CLDN17	P56750	224 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CLDN18	P56856	261 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MCHR2	Q969V1	340 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481		A8MXK9	166 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CTAG2	O75638	210 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHG1	P01857	330 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NMB	P08949	121 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PPP3CB	P16298	524 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	S100A11	P31949	105 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CLRN1	P58418	232 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	GLO1	Q04760	184 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SRY	Q05066	204 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MPPED2	Q15777	294 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB11B	Q15907	218 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MEP1B	Q16820	701 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1B0GTH9	108 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481		F5H5P2	479 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MPZL1	O95297	269 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC34A2	O95436	690 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RLN1	P04808	185 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF708	P17019	499 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC10A1	Q14973	349 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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