RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	IGKV3-11	P04433	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	GIMD1	P0DJR0	217 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FOLR2	P14207	255 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	PPT1	P50897	306 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	BID	P55957	195 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	NAA40	Q86UY6	237 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	DCUN1D4	Q92564	292 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	PRRT1	Q99946	306 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	UBE2C	O00762	179 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	OR1L3	Q8NH93	324 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FOLR1	P15328	257 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF20	P17024	532 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HSD11B1	P28845	292 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CD38	P28907	300 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ROM1	Q03395	351 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	RNF144B	Q7Z419	303 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	C14orf79	Q96F83	325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	NICN1	Q9BSH3	213 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	TSPAN2	O60636	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HLA-G	P17693	338 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CDA	P32320	146 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	NPY4R	P50391	375 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	LBX1	P52954	281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	GHRL	Q9UBU3	117 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HTR3B	O95264	441 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HCK	P08631	526 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FAM157C	P0CG43	387 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CFP	P27918	469 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FASLG	P48023	281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	GABRA4	P48169	554 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	EMP2	P54851	167 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	HSPB2	Q16082	182 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	FDX2	Q6P4F2	183 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	WBP1L	Q9NX94	342 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF44	P15621	663 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ARFRP1	Q13795	201 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MEF2D	Q14814	521 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SOX7	Q9BT81	388 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	RAB22A	Q9UL26	194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644		A0A1W2PPE3	182 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	RAB27B	O00194	218 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	CRH	P06850	196 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	PSMB6	P28072	239 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SMTN-223	ENST00000619644	SERPINF1	P36955	418 aa		12.86	□□□□□ -0.35

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