RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 PNPP00491 289 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 RAB32Q13637 225 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 LY6G6FQ5SQ64 297 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 P4HA3Q7Z4N8 544 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 FREM3P0C091 2139 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 A6NLC8 198 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ITGB2P05107 769 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CRHP06850 196 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 NCMAPQ5T1S8 102 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 TMPPEQ6ZT21 453 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 PIK3IP1Q96FE7 263 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 GABRG3Q99928 467 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 MMP26Q9NRE1 261 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 SULT2B1O00204 365 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 FMODQ06828 376 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CDC20BQ86Y33 519 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 FGF21Q9NSA1 209 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 A0A0G2JNG1 304 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 SHISA8B8ZZ34 492 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DS3K7RE56 304 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CTLA4P16410 223 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 SERPINA2P20848 420 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CRABP1P29762 137 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 GGTLC2Q14390 218 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 KIR2DS5Q14953 304 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 PRSS37A4D1T9 235 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF850A8MQ14 1090 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 H7C1Q1 480 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 LMX1BO60663 402 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ABCD3P28288 659 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CD1CP29017 333 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 F2RL1P55085 397 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 DEFA6Q01524 100 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 TLE3Q04726 772 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 OR4D6Q8NGJ1 314 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 NT5CQ8TCD5 201 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 RNF222A6NCQ9 220 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 MBTPS2O43462 519 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 LY86O95711 162 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 OMGP23515 440 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 RPL27P61353 136 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ACY1Q03154 408 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 LANCL3Q6ZV70 420 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 OR52N4Q8NGI2 321 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 OR51F2Q8NH61 342 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 FAM213BQ8TBF2 198 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ZDHHC12Q96GR4 267 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 KIRREL1Q96J84 757 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 ARL5BQ96KC2 179 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 CNTD2Q9H8S5 307 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 MED29Q9NX70 200 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 GHRLQ9UBU3 117 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHB4-210ENST00000616502 PATE3B3GLJ2 98 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 MASP2O00187 686 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 LYPD3O95274 346 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 IFNA17P01571 189 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 S100A8P05109 93 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 JMJD7P0C870 316 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 GABRR1P24046 479 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 SLC25A1P53007 311 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 SLC22A24Q8N4F4 322 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 ASB5Q8WWX0 329 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 A0A1W2PPH5 198 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 OR5K4A6NMS3 321 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 CYR61O00622 381 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 CAV2P51636 162 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 YPEL5P62699 121 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 TCEAL7Q9BRU2 100 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 CUTCQ9NTM9 273 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 KLRF1Q9NZS2 232 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 SIT1Q9Y3P8 196 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 GLRA1P23415 457 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 CALCRP30988 508 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHB4-210ENST00000616502 FCGR2CP31995 323 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms