RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-235ENST00000616247 RAB22AQ9UL26 194 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-235ENST00000616247 RP1P56715 2156 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-235ENST00000616247 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 F8VVB4 439 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 F8VWA3 439 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 H0Y8X5 98 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RAB27BO00194 218 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SOCS1O15524 211 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CYTIPO60759 359 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NKX2-2O95096 273 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OPN1LWP04000 364 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CEACAM5P06731 702 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SELLP14151 372 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CTLA4P16410 223 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 AGAP20933 346 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FXYD4P59646 89 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NAAAQ02083 359 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CHAF1BQ13112 559 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CD226Q15762 336 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MED25Q71SY5 747 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TAAR8Q969N4 342 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C5orf34Q96MH7 638 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OR2A5Q96R48 311 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TMEM100Q9NV29 134 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 LUZP4Q9P127 313 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 KLF15Q9UIH9 416 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 COL4A3Q01955 1670 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 A0A087WZY1 265 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GPR89BP0CG08 455 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CHATP28329 748 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC25A1P53007 311 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FMODQ06828 376 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CST6Q15828 149 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF77Q15935 545 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OR2T2Q6IF00 324 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 THRSPQ92748 146 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MR1Q95460 341 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 REEP6Q96HR9 211 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 LRFN5Q96NI6 719 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 WASF3Q9UPY6 502 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 JTBO76095 146 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SFT2D2O95562 160 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CST4P01036 141 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CTSBP07858 339 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FCGR3AP08637 254 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CISD3P0C7P0 127 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NR2C1P13056 603 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SP3Q02447 781 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HMGN3Q15651 99 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FHL5Q5TD97 284 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 AGBL4Q5VU57 503 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 BCORP1Q8N888 145 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GPR119Q8TDV5 335 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OR2M4Q96R27 311 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RARRES2Q99969 163 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NMES1Q9C002 83 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms