RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602272.5

FARP1-241, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene FARP1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1-241ENST00000602272 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TVP23AA6NH52 213 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 E7EQL1 145 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 E9PQ18 207 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 M0R129 80 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SGCEO43556 437 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PRKYO43930 277 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 DOK2O60496 412 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 GLCEO94923 617 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SNAP29O95721 258 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 DANCRP0C864 163 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 COX5BP10606 129 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PSKH1P11801 424 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CCL2P13500 99 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZNF823P16415 610 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CD53P19397 219 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SLC2A5P22732 501 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 STOMP27105 288 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 FMO3P31513 532 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 APLNRP35414 380 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 GGT2P36268 569 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 EFNB1P98172 346 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 RAB35Q15286 201 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TRIP10Q15642 601 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SNAPC1Q16533 368 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PCK2Q16822 640 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 KRT80Q6KB66 452 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZNF774Q6NX45 483 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZNF544Q6NX49 715 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CPOQ8IVL8 374 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TMEM163Q8TC26 289 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OTULINQ96BN8 352 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 MBOAT4Q96T53 435 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 DHRS9Q9BPW9 319 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZNF442Q9H7R0 627 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 MARCH7Q9H992 704 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CDH20Q9HBT6 801 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CA10Q9NS85 328 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CENPEQ02224 2701 aa5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PDZD2O15018 2839 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 APCP25054 2843 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR6C6A6NF89 314 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 RER1O15258 196 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SYNGR3O43761 229 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 IGLV2-14P01704 120 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SOD3P08294 240 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 SPARCP09486 303 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TMEM225BP0DP42 221 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TTKP33981 857 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 THBS4P35443 961 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 HTR5AP47898 357 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ENTPD1P49961 510 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 GDI2P50395 445 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 FABP6P51161 128 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 GALK2Q01415 458 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 KEAP1Q14145 624 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 KLHL12Q53G59 568 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TEX30Q5JUR7 227 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ELFN2Q5R3F8 820 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 LPCAT4Q643R3 524 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CORO6Q6QEF8 472 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TIGD4Q8IY51 512 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 GJC3Q8NFK1 279 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.84□□□□□ -1.47
FARP1-241ENST00000602272 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms