RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 RPL27P61353 136 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 HIST3H3Q16695 136 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SPRNQ5BIV9 151 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF813Q6ZN06 617 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF584Q8IVC4 421 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 FGFBP3Q8TAT2 258 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF519Q8TB69 540 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SYNPRQ8TBG9 265 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM54Q969K7 222 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 EMC6Q9BV81 110 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 OR52D1Q9H346 318 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.82□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 VGLL3A8MV65 326 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PRODHO43272 600 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 IDH3BO43837 385 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RAB36O95755 333 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 IFNGP01579 166 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 LCKP06239 509 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SBK2P0C263 348 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PGA4P0DJD7 388 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PGA3P0DJD8 388 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SLC6A6P31641 620 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 MAP2K4P45985 399 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RNLSQ5VYX0 342 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 GPR139Q6DWJ6 353 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 C11orf87Q6NUJ2 197 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SGCDQ92629 289 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 AMBNQ9NP70 447 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ASH2LQ9UBL3 628 aa12.81□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 A6NIZ1 184 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SRRM5B3KS81 715 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SPRY3O43610 288 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PRKYO43930 277 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SERPINI2O75830 405 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 INMTO95050 263 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFA7O95182 113 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 IGHG1P01857 330 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 MYL12AP19105 171 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 LOXL3P58215 753 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SELENOVP59797 346 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RAP1BP61224 184 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RAP1AP62834 184 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ERVK-25P63136 954 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 TMED1Q13445 227 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 LSAMPQ13449 338 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 CAMK2DQ13557 499 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 MELKQ14680 651 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SAMD5Q5TGI4 173 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf139Q6ZV77 190 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF627Q7L945 461 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 GID4Q8IVV7 300 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 LINC01006Q8NI28 216 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SAMD8Q96LT4 415 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ALG12Q9BV10 488 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 FN3KQ9H479 309 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 GPR160Q9UJ42 338 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ENPP5Q9UJA9 477 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa12.8□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 H3BMQ9 156 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 M0R129 80 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 BHLHE40O14503 412 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SLC22A1O15245 554 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PLATP00750 562 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 NR2C1P13056 603 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF250P15622 560 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SDHAP31040 664 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 SLC15A1P46059 708 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 CSNK1A1P48729 337 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF91Q05481 1191 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 PAX8Q06710 450 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 RAB40BQ12829 278 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 TIGD6Q17RP2 521 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
POLR2E-210ENST00000592597 LRFN4Q6PJG9 635 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms