RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM247	A6NEH6	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CD300LB	A8K4G0	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619		E9PBE3	544 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RFXANK	O14593	260 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CHP2	O43745	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ALDH3A1	P30838	453 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	GGT2	P36268	569 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	MTNR1B	P49286	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC25A1	P53007	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CAV3	P56539	151 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NME5	P56597	212 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	KIR2DS1	Q14954	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SEC23B	Q15437	767 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RGN	Q15493	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	GTDC1	Q4AE62	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	BBS10	Q8TAM1	723 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	VPS33A	Q96AX1	596 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RNFT2	Q96EX2	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	MED30	Q96HR3	178 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	GAFA1	Q96PS6	74 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SIGLEC5	O15389	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DEDD	O75618	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	OR7A10	O76100	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ARG1	P05089	322 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NR2C1	P13056	603 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SPN	P16150	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CTLA4	P16410	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	FST	P19883	344 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	PTMS	P20962	102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CD24	P25063	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CNTFR	P26992	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	OR3A4P	P47883	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ENTPD1	P49961	510 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NCALD	P61601	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	AQP6	Q13520	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DEFB136	Q30KP8	78 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	WDR82	Q6UXN9	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	PGAP1	Q75T13	922 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	WDR86	Q86TI4	376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619		Q8N1Y9	231 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	FNDC8	Q8TC99	324 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CDRT15	Q96T59	188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	NABP2	Q9BQ15	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	ODF3B	A8MYP8	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619		A8MZ25	164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	C5orf58	C9J3I9	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619		H3BUI4	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619		M0R3H8	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	CDIPT	O14735	213 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	MT-ND1	P03886	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DNMT1-222	ENST00000590619	IFNA6	P05013	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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