RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF749O43361 778 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CHP2O43745 196 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HCN1O60741 890 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CTNSO60931 367 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SDC3O75056 442 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB6O75190 326 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT1C4O75897 302 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT33AO76009 404 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK2O95069 426 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA7O95182 113 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RCBTB2O95199 551 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FSHBP01225 129 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 THY1P04216 161 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HMGN1P05114 100 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN19P0C672 248 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPA8P0DM63 369 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IFI30P13284 250 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LIFP15018 202 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR1FP30939 366 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRA3P34903 492 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SOX3P41225 446 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K8P41279 467 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RFX3P48380 749 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CTBP2P56545 445 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 COPZ1P61923 177 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXC5Q00444 222 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NAAAQ02083 359 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF45Q02386 682 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKCDQ05655 676 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SNTA1Q13424 505 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF141Q15928 474 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX1Q16384 188 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK14Q16539 360 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C3AR1Q16581 482 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HSDL2Q6YN16 418 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.59□□□□□ -1.83
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CAPNS1-210ENST00000590211 PFN4Q8NHR9 129 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM239Q8WW34 195 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UFD1Q92890 307 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FGF11Q92914 225 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZG16BQ96DA0 208 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF285Q96NJ3 590 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TGM7Q96PF1 710 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.59□□□□□ -1.83
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CAPNS1-210ENST00000590211 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52D1Q9H346 318 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SIAEQ9HAT2 523 aa3.59□□□□□ -1.83
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CAPNS1-210ENST00000590211 IL20Q9NYY1 176 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PRODH2Q9UF12 536 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MED31Q9Y3C7 131 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD6Q8TD26 2715 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.59□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRANK1O15050 2925 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087WZ39 114 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0B4J2E0 115 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GX12 115 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LMO7DNF2Z398 122 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC42EP2O14613 210 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HCRTR1O43613 425 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DUX1O43812 170 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GPX5O75715 221 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UPK1BO75841 260 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CSTAP01040 98 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNGP01579 166 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNA16P05015 189 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UMODP07911 640 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ADRA2AP08913 450 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HBQ1P09105 142 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GKN3PP0CG01 181 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DAOP14920 347 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF3P17036 446 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PTNP21246 168 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ETV5P41161 510 aa3.58□□□□□ -1.84
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