RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 CTXN1P60606 82 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ECH1Q13011 328 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR8G1Q15617 311 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MPPED2Q15777 294 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CDONQ4KMG0 1287 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CBLL1Q75N03 491 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SYT9Q86SS6 491 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DHFR2Q86XF0 187 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RASD2Q96D21 266 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RNF7Q9UBF6 113 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 KPTNQ9Y664 436 aa6.61□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OOEPA6NGQ2 149 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 A6NIZ1 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ARPC2O15144 300 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 GSC2O15499 205 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 IFNW1P05000 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PF4V1P10720 104 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TNFRSF1BP20333 461 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PAX6P26367 422 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CENPAP49450 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RGS6P49758 472 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RAP1BP61224 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RAP1AP62834 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MAB21L1Q13394 359 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 IFI44LQ53G44 452 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 C11orf88Q6PI97 169 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FNDC8Q8TC99 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM239Q8WW34 195 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RORBQ92753 470 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PYURFQ96I23 114 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 LRGUKQ96M69 825 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR5M11Q96RB7 305 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 SSX3Q99909 188 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 MUC13Q9H3R2 512 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1B0GW55 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 E9PQ18 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 XKRYO14609 159 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 OR5F1O95221 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 FSTL3O95633 263 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R3DO95685 299 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 PF4P02776 101 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 GRPP07492 148 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CA6P23280 308 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 CD200P41217 278 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX1-215ENST00000557428 KIR2DS4P43632 304 aa6.59□□□□□ -1.35
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