RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	OR8U8	P0C7N1	319 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF35	P13682	527 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MGMT	P16455	207 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF708	P17019	499 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CD33	P20138	364 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GAL	P22466	123 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	BDKRB2	P30411	391 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NTS	P30990	170 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MAP3K8	P41279	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MC3R	P41968	323 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RIPPLY3	P57055	190 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ACSM1	Q08AH1	577 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GINS1	Q14691	196 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PEA15	Q15121	130 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SSX2	Q16385	188 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR2M3	Q8NG83	312 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NRGN	Q92686	78 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PMM1	Q92871	262 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FOXC2	Q99958	501 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DUSP26	Q9BV47	211 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GGACT	Q9BVM4	153 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NOX3	Q9HBY0	568 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		5.74	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IRGM	A1A4Y4	181 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR2T1	O43869	369 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV2-5	P01817	119 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	COX5B	P10606	129 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DPP4	P27487	766 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GIPR	P48546	466 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PITPNA	Q00169	270 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FOXF2	Q12947	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NEU1	Q99519	415 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DKKL1	Q9UK85	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C17orf51	A8MQB3	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RNF13	O43567	381 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HTR5A	P47898	357 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ART1	P52961	327 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GMFB	P60983	142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CDK6	Q00534	326 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PDE7A	Q13946	482 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DECR1	Q16698	335 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CDNF	Q49AH0	187 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CDC20B	Q86Y33	519 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984		F5H5P2	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAAH	O00519	579 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CTDSPL	O15194	276 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TNFSF13	O75888	250 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NKX2-2	O95096	273 aa		5.72	□□□□□ -1.49

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