RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 A0A1B0GUH1 482 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR2M5A3KFT3 312 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CD8B2A6NJW9 211 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 C9orf172C9J069 976 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 H7C1C5 153 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 XKRYO14609 159 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SSNA1O43805 119 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 AKR7A3O95154 331 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR6A2O95222 327 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SIX6O95475 246 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MT-CO3P00414 261 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ALDOBP05062 364 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CD8BP10966 210 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPA2P15927 270 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 AHCYP23526 432 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OTX2P32243 289 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 GDNFP39905 211 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SSR4P51571 173 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CCR6P51684 374 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PRKXP51817 358 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 LCN6P62502 163 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MXD1Q05195 221 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TRAM1Q15629 374 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MPPED2Q15777 294 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ACKR1Q16570 336 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 HAGHQ16775 308 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ARL9Q6T311 187 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR6V1Q8N148 313 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR5T1Q8NG75 326 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ZNF519Q8TB69 540 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 THAP4Q8WY91 577 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PELI1Q96FA3 418 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TSSK2Q96PF2 358 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 GINS4Q9BRT9 223 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SPRY4Q9C004 299 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ABCG5Q9H222 651 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 NCDNQ9UBB6 729 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PRSS37A4D1T9 235 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 DCTN6O00399 190 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 FZD7O75084 574 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 F10P00742 488 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TFPIP10646 304 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MGMTP16455 207 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ADCYAP1P18509 176 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 IL11P20809 199 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ACVR1BP36896 505 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PPT1P50897 306 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 MLF1P58340 268 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SPEM2Q0P670 501 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ZP4Q12836 540 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 INSL4Q14641 139 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 OR7A5Q15622 319 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 ST3GAL2Q16842 350 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 TP53I3Q53FA7 332 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPTNQ6XPR3 784 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 LRRC18Q8N456 261 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 RELTQ969Z4 430 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-204ENST00000546621 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.92□□□□□ -1.3
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