RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ADIGQ0VDE8 80 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 FOXF1Q12946 379 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GPR18Q14330 331 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF235Q14590 738 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 RNF151Q2KHN1 245 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GPR157Q5UAW9 335 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 OR2T27Q8NH04 317 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GPR119Q8TDV5 335 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 ARRDC3Q96B67 414 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 APIPQ96GX9 242 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 C4orf36Q96KX1 117 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 C2orf50Q96LR7 162 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ATP6V0BQ99437 205 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 P2RX4Q99571 388 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GABRG3Q99928 467 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 SPXQ9BT56 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 COA1Q9GZY4 146 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 KATNBL1Q9H079 304 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CMC2Q9NRP2 79 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ANKRD10Q9NXR5 420 aa5.49□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 RNF24Q9Y225 148 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LRP12Q9Y561 859 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LTBP1Q14766 1721 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ANTXRLA6NF34 631 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 FAM227AF5H4B4 570 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 H0YIZ8 118 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 PEX12O00623 359 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 CNMDO75829 334 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CD3DP04234 171 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 REG1AP05451 166 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CSN2P05814 226 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CKMP06732 381 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR10J4P0C629 311 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PGA4P0DJD7 388 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PGA5P0DJD9 388 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FPR2P25090 351 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 AQP2P41181 271 aa5.48□□□□□ -1.53
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SNHG1-211ENST00000539921 CAMLGP49069 296 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 THBS3P49746 956 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 HMGCS2P54868 508 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FOXC1Q12948 553 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PPP1R1AQ13522 171 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 BEX5Q5H9J7 111 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 COX20Q5RI15 118 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LEG1Q6P5S2 330 aa5.48□□□□□ -1.53
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