RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.02■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM181BA6NEQ2 426 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 OOEPA6NGQ2 149 aa16.01■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 C22orf46C9J442 243 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 XRCC2O43543 280 aa16.01■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.01■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 WDFY2Q96P53 400 aa16■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 TBX1O43435 398 aa15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 SFTPBP07988 381 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.99■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF878C9JN71 531 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF826PQ6ZT77 177 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR3DL3Q8N743 410 aa15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 TEX30Q5JUR7 227 aa15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 LHX4Q969G2 390 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TOR3AQ9H497 397 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV1-69P01742 117 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 MELTFP08582 738 aa15.96■□□□□ 0.15
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