RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TOMM40O96008 361 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IFNA21P01568 189 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RPN2P04844 631 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CHRM2P08172 466 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TACSTD2P09758 323 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NPSP0C0P6 89 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NR2F1P10589 423 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CTSAP10619 480 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IL11P20809 199 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ACRV1P26436 265 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 WNT5AP41221 380 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GDF5P43026 501 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CSNK1DP48730 415 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NPY4RP50391 375 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PDX1P52945 283 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MAXP61244 160 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HSF1Q00613 529 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF85Q03923 595 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LTBQ06643 244 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RAB11BQ15907 218 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GRINAQ7Z429 371 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 BIVMQ86UB2 503 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC35G3Q8N808 338 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SFXN5Q8TD22 340 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HASPINQ8TF76 798 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SMPDL3AQ92484 453 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ISOC2Q96AB3 205 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TVP23CQ96ET8 276 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SMIM12Q96EX1 92 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DERL3Q96Q80 235 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR10A5Q9H207 317 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CDH20Q9HBT6 801 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KCNK6Q9Y257 313 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 U3KQE9 123 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MYO10Q9HD67 2058 aa6.4□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 EPOPA6NHQ4 379 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CLDN34H7C241 214 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 J3QLW9 94 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DCTN6O00399 190 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HMGN4O00479 90 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BHLHE40O14503 412 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DNPH1O43598 174 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF4O60810 478 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 GPANK1O95872 356 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IL18BPO95998 194 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CYB5AP00167 134 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM5P06731 702 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF735P0CB33 412 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 TRGC1P0CF51 173 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 ZNF19P17023 458 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DTYMKP23919 212 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 BRS3P32247 399 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PYCR1P32322 319 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 OPRD1P41143 372 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 KHKP50053 298 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 IL13RA1P78552 427 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 PAX5Q02548 391 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 CD69Q07108 199 aa6.39□□□□□ -1.39
PKP4-211ENST00000481115 DUSP8Q13202 625 aa6.39□□□□□ -1.39
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