RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-215	ENST00000438141	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141		A0A0A6YYH2	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141		A6NJ64	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	DHRS3	O75911	302 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	BPNT1	O95861	308 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC6A9	P48067	706 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RAG2	P55895	527 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PSG4	Q00888	419 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	NHLH1	Q02575	133 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	UNC119	Q13432	240 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	C3AR1	Q16581	482 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ALDOB	P05062	364 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CPN1	P15169	458 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	THBS4	P35443	961 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RAB25	P57735	213 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CLN3	Q13286	438 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RTP5	Q14D33	572 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	EXO5	Q9H790	373 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ALX3	O95076	343 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PRF1	P14222	555 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF24	P17028	368 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CCL11	P51671	97 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PCBD1	P61457	104 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PMPCA	Q10713	525 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58	2e-11	■■■■■ 40.1
TTLL3-215	ENST00000438141	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	C10orf35	Q96D05	121 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RAB27B	O00194	218 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	SULT1C2	O00338	296 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RBBP9	O75884	186 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	YES1	P07947	543 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	PRSS3	P35030	304 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-215	ENST00000438141	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms