RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 A0A0B4J2A0 478 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 C5orf51A6NDU8 294 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 C21orf140B9A014 251 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 C9orf172C9J069 976 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 EFSO43281 561 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 KCNAB3O43448 404 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 STK17BO94768 372 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SMIM6P0DI80 62 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 NAT2P11245 290 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RAB6AP20340 208 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 VAMP1P23763 118 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RAB5BP61020 215 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ROM1Q03395 351 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 BIKQ13323 160 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 NNATQ16517 81 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 KCTD9Q7L273 389 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 FJX1Q86VR8 437 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ZFP82Q8N141 532 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TMED6Q8WW62 240 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 GPR87Q9BY21 358 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 WDR54Q9H977 334 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 EDARQ9UNE0 448 aa7.25□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 IGHEP01854 428 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 HLA-DQA2P01906 255 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 S100A8P05109 93 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 NFYBP25208 207 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SERPINF1P36955 418 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 PTGFRP43088 359 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SLC6A9P48067 706 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CX3CR1P49238 355 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CLDN6P56747 220 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SKP2Q13309 424 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 PEA15Q15121 130 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 GATSQ8NAP1 163 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ELP5Q8TE02 316 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CRB3Q9BUF7 120 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RNF126Q9BV68 326 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 B9D1Q9UPM9 204 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 WIPF3A6NGB9 483 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 COLCA2A8K830 154 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 LINC00587B1AMM8 73 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 OIP5O43482 229 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 HCRTR1O43613 425 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 GLAP06280 429 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 AKR1C4P17516 323 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 MAOAP21397 527 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 PAX6P26367 422 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 DNASE1L1P49184 302 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CENPAP49450 140 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CAV2P51636 162 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 CCR4P51679 360 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 TAS2R31P59538 309 aa7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RRN3-203ENST00000429751 ECH1Q13011 328 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms