RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 GADD45AP24522 165 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MPIP34949 423 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTGDSP41222 190 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC1A3P43003 542 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CRYBB2P43320 205 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RFX2P48378 723 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GSSP48637 474 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PPOXP50336 477 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RORCP51449 518 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 XKP51811 444 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NCS1P62166 190 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 BDH1Q02338 343 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN31Q12999 210 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SPHARQ15513 63 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NNATQ16517 81 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DECR1Q16698 335 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CASP12Q6UXS9 341 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZT83 130 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR10D3Q8NH80 312 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HGDQ93099 445 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM19Q96HH6 336 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PRRC1Q96M27 445 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF681Q96N22 645 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGDIGQ99819 225 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TEX12Q9BXU0 123 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TIGARQ9NQ88 270 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 POLE3Q9NRF9 147 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NUP50Q9UKX7 468 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EXPH5Q8NEV8 1989 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LCE6AA0A183 80 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ENTPD6O75354 484 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RAD51DO75771 328 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR5F1O95221 314 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GPR75O95800 540 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AK1P00568 194 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTHP01270 115 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV3-20P01619 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 APOA1P02647 267 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OPN1MWP04001 364 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HMGN1P05114 100 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 YES1P07947 543 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LYNX1P0DP58 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ACP2P11117 423 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NTSP30990 170 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR1E2P47887 323 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GAS1P54826 345 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CARD18P57730 90 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ST3GAL3Q11203 375 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CBX3Q13185 183 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EFR3AQ14156 821 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRAM2Q15035 370 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA5Q16718 116 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HBMQ6B0K9 141 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT10Q86SR1 603 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms