RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLK3Q9H4B4 646 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGCCQ9H4X1 137 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DUSP21Q9H596 190 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMG20AQ9NP66 347 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCN3BQ9NY72 215 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CMAHPQ9Y471 501 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 R4GMQ9 66 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBN2P35556 2912 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM129A0AVI4 362 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ISPDA4D126 451 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM64BA6NI03 449 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYSRT1A8MQ03 144 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B9A039 149 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMD9O00233 223 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 XRCC2O43543 280 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNPP00491 289 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD8AP01732 235 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV3-13P01766 116 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDK1P06493 297 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TACSTD2P09758 323 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC2A1P11166 492 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAC2P15153 192 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KITLGP21583 273 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANOS1P23352 680 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ETV1P50549 477 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR12D2P58182 307 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MVKQ03426 396 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MALLQ13021 153 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OXA1LQ15070 435 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA46Q5T0L3 261 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGAP6Q5VW22 663 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIPNQ5VXI9 398 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf71Q6IPW1 123 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LHFPL3Q86UP9 236 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXL14Q8N1E6 418 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF786Q8N393 782 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STX19Q8N4C7 294 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YIPF7Q8N8F6 280 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF485Q8NCK3 441 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR52N1Q8NH53 320 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNPRQ8TBG9 265 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RORBQ92753 470 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HAVCR1Q96D42 359 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PELI1Q96FA3 418 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C4orf36Q96KX1 117 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LURAP1Q96LR2 239 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UQCC2Q9BRT2 126 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR10A2Q9H208 303 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR51B6Q9H340 312 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POFUT1Q9H488 388 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OPA3Q9H6K4 179 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBTD1Q9HAC8 227 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CBLN4Q9NTU7 201 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF319Q9P2F9 582 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNG8Q9UK08 70 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDARQ9UNE0 448 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX5Q9Y5X3 404 aa7□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNA1DQ01668 2161 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0U1RQV5 110 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5orf63A6NC05 138 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTGES3LE9PB15 166 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H7C417 338 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OVOL3O00110 214 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BET1O15155 118 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATE1O95260 518 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGLV3-1P01715 115 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTRP02766 147 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT-ND5P03915 603 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAF1P04049 648 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BMP4P12644 408 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAX1P15863 534 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SELEP16581 610 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD53P19397 219 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms