RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTR1AP61163 376 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf135Q5VTT2 229 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC8B1Q6J4K2 584 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 REEP3Q6NUK4 255 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCKQ8N0W5 287 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBAC2Q8NBM4 344 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 C19orf18Q8NEA5 215 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR9K2Q8NGE7 335 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC2A14Q8TDB8 520 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RXFP4Q8TDU9 374 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4K3Q96R72 315 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNS3Q9BQ31 491 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TOLLIPQ9H0E2 274 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABCG5Q9H222 651 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RETNQ9HD89 108 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF302Q9NR11 478 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC39A1Q9NY26 324 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 PISDQ9UG56 409 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 HES2Q9Y543 173 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ISPDA4D126 451 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7EMT4 169 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIRPB1O00241 398 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGM6O95932 706 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPINA3P01011 423 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD70P32970 193 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCK1P35558 622 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB7AP51149 207 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFITM3Q01628 133 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAM2Q15035 370 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF141Q15928 474 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPPQ6IPU0 288 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPNS3Q6ZMD2 512 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZSR6 202 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ORMDL3Q8N138 153 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX9Q8N6V9 391 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCAKDQ8WVC6 231 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPSLQ8WWF8 208 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNS1Q96KK3 526 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTN2A3PQ96KV6 586 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2V2Q96R30 315 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPKQ9BS16 269 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 DSN1Q9H410 356 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 THADAQ6YHU6 1953 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 C15orf65H3BRN8 121 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 M0R1X1 148 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2J3O76001 311 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP8O94778 261 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAS1P04201 325 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1-16P04430 117 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 THRAP10827 490 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFI30P13284 250 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTRB1P17538 263 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 NELFEP18615 380 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYL9P24844 172 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MPIP34949 423 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 BMI1P35226 326 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGM4P49221 684 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP12-1P59990 96 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAB1Q13506 487 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSX2Q16385 188 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKDD1AQ495B1 522 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF470Q6ECI4 717 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RGS9BPQ6ZS82 235 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMPPEQ6ZT21 453 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC16A14Q7RTX9 510 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 DRAM1Q8N682 238 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR56B2PQ8NGI1 322 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR52N1Q8NH53 320 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC7Q8TAX7 377 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTL9Q8TC94 416 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDS1Q92903 461 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 NT5C3BQ969T7 300 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIGUQ9H490 435 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLN8Q9UBY8 286 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMCO3A2RU48 225 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 D6RAR5 112 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAD1O60671 282 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPRT1P00492 218 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRASP01111 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRASP01112 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRASP01116 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CBR1P16152 277 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms