RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRGNQ92686 78 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRBF2Q96F24 287 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZYG11BQ9C0D3 744 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM38AQ9H6F2 299 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RETNQ9HD89 108 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FHOD3Q2V2M9 1422 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A075B6Q4 140 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCE1LA8MT33 242 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF11BO00300 401 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFNGO00587 321 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL2O95198 593 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSM8O95777 96 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPRT1P00492 218 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HBE1P02100 147 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB4AP20338 218 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTF3P20783 257 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL32P24001 234 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 STOMP27105 288 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R46P59540 309 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BEX3Q00994 111 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MERTKQ12866 999 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ART3Q13508 389 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNOCQ13519 176 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGCR6Q14129 220 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF266Q14584 549 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCF4Q15080 339 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCN1Q15293 331 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL12Q53G59 568 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEGS2Q6QHC5 323 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERO1BQ86YB8 467 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGPP2Q8IWX5 399 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTN2A3PQ96KV6 586 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF145Q96MT1 663 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSDMAQ96QA5 445 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC22CQ9BRL7 303 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARVELD1Q9BSK0 173 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLN6Q9NWW5 311 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A7Q9P2U7 560 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABL2BQ9UNT1 228 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM64CA6NLI5 447 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C1H1 209 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QRE1 110 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R3G1 203 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAAR5O14804 337 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINB7O75635 380 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNB2O95067 398 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PFN1P07737 140 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMOX2P30519 316 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALR1P47211 349 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCRFS1P47985 274 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB9AP51151 201 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB134Q4QY38 66 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM220Q6QAJ8 160 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf54Q6X4T0 127 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSX9Q7RTT3 188 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LUZP2Q86TE4 346 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NT5DC3Q86UY8 548 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRG1Q8N1C3 465 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK40Q8N2I9 435 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 JAGN1Q8N5M9 183 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX31Q8N9S9 440 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2Z1Q8NG97 314 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGDQ93099 445 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR82Q96P67 336 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PANX1Q96RD7 426 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM243Q9BU79 118 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 UCK2Q9BZX2 261 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOLLIPQ9H0E2 274 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00574Q9H8X3 128 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB20Q9NX57 234 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A1Q9NY26 324 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCNT4Q9P109 453 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLN8Q9UBY8 286 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAR1BQ9Y6B6 198 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 THADAQ6YHU6 1953 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1DQ01668 2161 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN11A1L157 253 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRPO00591 440 aa1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms