RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 STEAP1BQ6NZ63 245 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SLC39A7Q92504 469 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CHST11Q9NPF2 352 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SIGLEC5O15389 551 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MT-CO3P00414 261 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CCL3P10147 92 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ABOP16442 354 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGDIBP52566 201 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 H3F3CQ6NXT2 135 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM229BQ8NBD8 167 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 INTS14Q96SY0 518 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CDC6Q99741 560 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 POFUT1Q9H488 388 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 WDR76Q9H967 626 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00587B1AMM8 73 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZFPL1O95159 310 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CRYBA1P05813 215 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS3P35030 304 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 DLSTP36957 453 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ECH1Q13011 328 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MNTQ99583 582 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ANGPTL4Q9BY76 406 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MMP26Q9NRE1 261 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TTLL8A6PVC2 850 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 F8VVB4 439 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 F8VWA3 439 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LRP3O75074 770 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PTHLHP12272 177 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 S100PP25815 95 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TLE3Q04726 772 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 Q0VFX4 171 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MYBPHQ13203 477 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SSPNQ14714 243 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RAB12Q6IQ22 244 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ASB10Q8WXI3 467 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A28Q96A46 364 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 NTNG2Q96CW9 530 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PROK2Q9HC23 129 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 HSPB2A8KAH6 182 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 UBE2CO00762 179 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SGCEO43556 437 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SLC16A7O60669 478 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CTAG2O75638 210 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CASRP41180 1078 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 HSPB2Q16082 182 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM156Q8N614 296 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GPX8Q8TED1 209 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RNF141Q8WVD5 230 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 C5orf34Q96MH7 638 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR51M1Q9H341 326 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 A6NIZ1 184 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 NPIPB13A6NJU9 1138 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 NPIPB4C9JG80 1138 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD16AO95870 558 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 CTLA4P16410 223 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 ADRA2CP18825 462 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 ALOX5APP20292 161 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 RAP1BP61224 184 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 RAP1AP62834 184 aa16.52■□□□□ 0.23
SPNS1-204ENST00000352260 CHAF1BQ13112 559 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms