RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf76Q3KRA6 126 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 RTN4RQ9BZR6 473 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 UBQLN4Q9NRR5 601 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RASL12Q9NYN1 266 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 POLEQ07864 2286 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 POM121CA8CG34 1229 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4E1P0C645 316 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A4P12235 298 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SORDQ00796 357 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC7Q5VTL7 733 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GLT8D1Q68CQ7 371 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS35Q8N3Z0 413 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOSQ8NHW6 89 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 FKRPQ9H9S5 495 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM82A0PJX8 343 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa23.28■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 CD3DP04234 171 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RFPL3SP0C7P2 107 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CD37P11049 281 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM180AQ6UWF9 173 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF546Q86UE3 836 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNRGQ8N5I3 272 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D10Q8NGI6 311 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA2Q92186 375 aa23.28■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 IFT46Q9NQC8 304 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CKLFQ9UBR5 152 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ESPL1Q14674 2120 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53I11O14683 189 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G2AP14555 144 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 IL12BP29460 328 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MESTQ5EB52 335 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 LIN54Q6MZP7 749 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP77Q6ZQR2 320 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MOGAT1Q96PD6 335 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8B4Q96RC9 309 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR160Q9UJ42 338 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM166BA8MTA8 275 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM10O14672 748 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR7A3O95154 331 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3DO95716 219 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3AP20336 220 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR3DL2P43630 455 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G7Q13093 441 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MOB3CQ70IA8 216 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY19L4Q7Z388 723 aa23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTI1 187 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 ABCD4O14678 606 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 IL33O95760 270 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA5P08648 1049 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HPGDP15428 266 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FSTP19883 344 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TDGF1P3P51864 188 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 EFNB2P52799 333 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PNLIPRP2P54317 469 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SKP2Q13309 424 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX30Q5JUR7 227 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCC3Q6UW78 93 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10Z1Q8NGY1 313 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 PTX4Q96A99 478 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM173AQ9BQD7 235 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TTTY12Q9BZ98 90 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL7AQ9H8H3 244 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC3CA6NJW4 275 aa23.25■■□□□ 1.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 SPDEFO95238 335 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CD2P06729 351 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CELA3AP09093 270 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRFS1P47985 274 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A8P48029 635 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A1Q14916 467 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND11Q15326 602 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR38Q5JTN6 314 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5M8Q8NGP6 311 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF128Q8TEB7 428 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NTNG2Q96CW9 530 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL4Q9BY76 406 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA1Q9UND3 350 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF3C1Q12789 2109 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa23.25■■□□□ 1.31
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