RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PARP11Q9NR21 331 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM206AQ9NX38 181 aa20.3■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNAB3O43448 404 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 NUDT14O95848 222 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SFTA3P0C7M3 94 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PTAFRP25105 342 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SULT1A2P50226 295 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM230Q96A57 120 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 HRH4Q9H3N8 390 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM231Q9H6L2 316 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LMX1BO60663 402 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO24O75426 580 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FCGR3AP08637 254 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 GNALP38405 381 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 EMP2P54851 167 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 IL15RAQ13261 267 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 Q7L0L9 218 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 OCSTAMPQ9BR26 566 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TCEAL7Q9BRU2 100 aa20.29■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 MSGN1A6NI15 193 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT7O43581 403 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TSPAN2O60636 221 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FARS2O95363 451 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 S100A9P06702 114 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ADH6P28332 368 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 F2RL1P55085 397 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 BTNL8Q6UX41 500 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KPTNQ9Y664 436 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf196B1AJZ1 125 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 MPZL1O95297 269 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TTRP02766 147 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FREM3P0C091 2139 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCD3P28288 659 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PTGFRP43088 359 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ASB10Q8WXI3 467 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TAF9BQ9HBM6 251 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 LANCL2Q9NS86 450 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 OR5AC2Q9NZP5 309 aa20.28■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE2CO00762 179 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 NFYBP25208 207 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CD27P26842 260 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 CD1CP29017 333 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 PMELP40967 661 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 POC1AQ8NBT0 407 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF721Q8TF20 911 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 C2CD4CQ8TF44 421 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 TUBA4BQ9H853 241 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.27■□□□□ 0.84
ANKRD54-201ENST00000215941 C5orf52A6NGY3 159 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 CST4P01036 141 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 GABRA4P48169 554 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 CLDN6P56747 220 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 LHFPL1Q86WI0 220 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 LYPD6BQ8NI32 183 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNK17Q96T54 332 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.27■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 CD38P28907 300 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 COMMD1Q8N668 190 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR119Q8TDV5 335 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB3CQ96E17 227 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 PISDQ9UG56 409 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 EDARQ9UNE0 448 aa20.26■□□□□ 0.83
ANKRD54-201ENST00000215941 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms