RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 SPINK14Q6IE38 97 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SUN5Q8TC36 379 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 NELFAQ9H3P2 528 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 HSPB11Q9Y547 144 aa15.95■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GUH1 482 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF20P17024 532 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RAB3AP20336 220 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 M6PRP20645 277 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FAM209AQ5JX71 171 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF529Q6P280 563 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 DHHO43323 396 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 TGM6O95932 706 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CYB561P49447 251 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CCL11P51671 97 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 P2RX3P56373 397 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GALNT16Q8N428 558 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 C9orf62Q8N4C0 152 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CMBLQ96DG6 245 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 HYLS1Q96M11 299 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SFXN2Q96NB2 322 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.94■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 TMEM235A6NFC5 223 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GJE1A6NN92 205 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 PRAF2O60831 178 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CRYZL1O95825 349 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RAC3P60763 192 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GINS4Q9BRT9 223 aa15.93■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 F5H5K5 113 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CXCL13O43927 109 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 C1QTNF9P0C862 333 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 AKAIN1P0CW23 69 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 VSIG8P0DPA2 414 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 NR2C1P13056 603 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 OR5AS1Q8N127 324 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 FAM117AQ9C073 453 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF69Q9UC07 566 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ING4Q9UNL4 249 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RAXQ9Y2V3 346 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 LPLP06858 475 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GDF1P27539 372 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RFC3P40938 356 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CLDN15P56746 228 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 CARD18P57730 90 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 QRFPP83859 136 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZNF767PQ75MW2 155 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 LYZL4Q96KX0 146 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 IP6K3Q96PC2 410 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 DLL4Q9NR61 685 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 BSNQ9UPA5 3926 aa15.92■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 DBHP09172 617 aa15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 AWAT2Q6E213 333 aa15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.91■□□□□ 0.14
USP18-201ENST00000215794 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms