RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 PSMB6P28072 239 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LAP3P28838 519 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CX3CR1P49238 355 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR1D5P58170 312 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MC2RQ01718 297 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NAAAQ02083 359 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ATRAIDQ6UW56 229 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CMBLQ96DG6 245 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 C5orf34Q96MH7 638 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MED29Q9NX70 200 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.01□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 VSTM2BA6NLU5 285 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NUDT19A8MXV4 375 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC34A2O95436 690 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MSX1P28360 303 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 AVPR2P30518 371 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 BIDP55957 195 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NXPH1P58417 271 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FOXK1P85037 733 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CFHR1Q03591 330 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CCDC157Q569K6 752 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 C1orf189Q5VU69 101 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 AWAT2Q6E213 333 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ELP2Q6IA86 826 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PGAP1Q75T13 922 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CLRN3Q8NCR9 226 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CADM4Q8NFZ8 388 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR4K15Q8NH41 348 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TERB2Q8NHR7 220 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NUBPLQ8TB37 319 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NPAS1Q99742 590 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LPAR5Q9H1C0 372 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FN3KRPQ9HA64 309 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SERINC1Q9NRX5 453 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MBD2Q9UBB5 411 aa9□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FAM25EA8MYX2 175 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF878C9JN71 531 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 GNB3P16520 340 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF20P17024 532 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 VAMP1P23763 118 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 EMP2P54851 167 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FBXW4P57775 412 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FOXF1Q12946 379 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 COX15Q7KZN9 410 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NAA40Q86UY6 237 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ESX1Q8N693 406 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 HLA-CQ95604 372 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 FOXQ1Q9C009 403 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM100Q9NV29 134 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 MYO9BQ13459 2157 aa8.99□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.98□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.98□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SAMMSON-218ENST00000641601 LYL1P12980 280 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms