RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 UPRTQ96BW1 309 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RNF31Q96EP0 1072 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRG7Q96K78 797 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TECTBQ96PL2 329 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ABHD1Q96SE0 405 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 NPAS1Q99742 590 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 GP6Q9HCN6 339 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 LRFN1Q9P244 771 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.21□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1B0GUH1 482 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 DHHO43323 396 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CYTIPO60759 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PEX14O75381 377 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CTAG2O75638 210 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PNPP00491 289 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TTRP02766 147 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MAS1P04201 325 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 LPLP06858 475 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CST2P09228 141 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ACSM4P0C7M7 580 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CDK2P24941 298 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 STOMP27105 288 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 BTCP35070 178 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 THBS4P35443 961 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 GNALP38405 381 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PTH2RP49190 550 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 GFRA1P56159 465 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CBX3Q13185 183 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MAB21L1Q13394 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ETFDHQ16134 617 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SLC36A2Q495M3 483 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CD276Q5ZPR3 534 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RTL6Q6ICC9 239 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 DRAM2Q6UX65 266 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FCRLAQ7L513 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MED30Q96HR3 178 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 GNRHR2Q96P88 292 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RGCCQ9H4X1 137 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CENPMQ9NSP4 180 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MCUBQ9NWR8 336 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 NLKQ9UBE8 527 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 UPB1Q9UBR1 384 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.2□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FRYLO94915 3013 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FREM3P0C091 2139 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 COL6A3P12111 3177 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1W2PPK0 400 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FAM172BPA6NC97 362 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 H7C417 338 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TNFSF11O14788 317 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 SSX4O60224 188 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RBBP9O75884 186 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 GPANK1O95872 356 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TGM6O95932 706 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ACTL6AO96019 429 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 IGLV3-1P01715 115 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 C1QBP02746 253 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TCRBP04435 133 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 MELTFP08582 738 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ITGA5P08648 1049 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 FCGR2AP12318 317 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CPN1P15169 458 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 TNFRSF1AP19438 455 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RCVRNP35243 200 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 ALDH3B1P43353 468 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CX3CR1P49238 355 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CLDN6P56747 220 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 CARD18P57730 90 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 DGCR2P98153 550 aa7.19□□□□□ -1.26
CTXN3-204ENST00000620385 Q0VFX4 171 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms