RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UBD	O15205	165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CFLAR	O15519	480 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UGT2B17	O75795	530 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LINGO3	P0C6S8	592 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ETFA	P13804	333 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IDO1	P14902	403 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UQCRC2	P22695	453 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	S100A3	P33764	101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	EVX1	P49640	407 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	AQP5	P55064	265 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PSPH	P78330	225 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FOXF1	Q12946	379 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SKP2	Q13309	424 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF141	Q15928	474 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LY6E	Q16553	131 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SYPL1	Q16563	259 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RNF130	Q86XS8	419 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ANKFN1	Q8N957	763 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP90	Q8TF47	636 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NSMAF	Q92636	917 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GTF2H4	Q92759	462 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	OR52E6	Q96RD3	313 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MED17	Q9NVC6	651 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CBY3	A6NI87	242 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	AP3D1	O14617	1153 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BUB3	O43684	328 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SLC22A3	O75751	556 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	H6PD	O95479	791 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CLIC3	O95833	236 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	THY1	P04216	161 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ANOS1	P23352	680 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LCN1	P31025	176 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PGM1	P36871	562 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ATP12A	P54707	1039 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	BPIFB3	P59826	476 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	SELPLG	Q14242	412 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GPR68	Q15743	365 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GSTA3	Q16772	222 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	NATD1	Q8N6N6	113 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	GPR119	Q8TDV5	335 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	LHX4	Q969G2	390 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MLH1-223	ENST00000616768	MAL2	Q969L2	176 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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