RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV6A0A075B6T7 132 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GUH1 482 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 WISP2O76076 250 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYABP02511 175 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 MT-ND4P03905 459 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA5P08648 1049 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF43P17038 809 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf76Q3KRA6 126 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF766Q5HY98 468 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ASPHD2Q6ICH7 369 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1J4Q8NGS1 313 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13C3Q8NGS6 347 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GRPEL2Q8TAA5 225 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf85Q9H1P6 137 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ING4Q9UNL4 249 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SHISA8B8ZZ34 492 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 IL5P05113 134 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA3P12429 323 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB6AP20340 208 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A1P23297 94 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR2CP28335 458 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PER3P56645 1201 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 H3F3AP84243 136 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL11BQ5VVY1 283 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH26Q8IXH8 852 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51D1Q8NGF3 324 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SVILO95425 2214 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CIB4A0PJX0 185 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GJE1A6NN92 205 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF726A6NNF4 738 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF878C9JN71 531 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT2B1O00204 365 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAPC5O75971 98 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT11O96014 354 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTT2P0CG29 244 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD11B1P28845 292 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FCN2Q15485 313 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPD6Q86Y78 171 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA12Q8IW75 414 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 NOTCH2Q04721 2471 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LDLRAD4O15165 306 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ZG16O60844 167 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1A3P0DMM9 295 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1A4P0DMN0 295 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR6P51684 374 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM6P62312 80 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PMP22Q01453 160 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ODF4Q2M2E3 257 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GFRALQ6UXV0 394 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 MDGA2Q7Z553 956 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FJX1Q86VR8 437 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 WDFY1Q8IWB7 410 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R4Q9NYW5 299 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CBR3O75828 277 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SCGNO76038 276 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSSP25774 331 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1C1Q15619 314 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SPINK14Q6IE38 97 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM53Q6P2H8 277 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LUZP2Q86TE4 346 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00346Q8IVM7 164 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCC2Q9BRT2 126 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 BEX2Q9BXY8 128 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 HES7Q9BYE0 225 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 HPF1Q9NWY4 346 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FBLN5Q9UBX5 448 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 NPTNQ9Y639 398 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YC42 278 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK2AP1O14519 115 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 NEURL1O76050 574 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFB6O95139 128 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTBP60709 375 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTG1P63261 375 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf128Q5T292 105 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM109AQ8N4B1 249 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM156Q8N614 296 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP1Q8WWP7 306 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.39■■□□□ 1.18
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