RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556082.5

ATXN3-235, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-235ENST00000556082 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 P2RY10O00398 339 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 SYT7O43581 403 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 LANCL1O43813 399 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ALDOBP05062 364 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ITGA5P08648 1049 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 CPN1P15169 458 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 HLA-DMAP28067 261 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 HTR2CP28335 458 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 RAG2P55895 527 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 AP3S2P59780 193 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 GPR176Q14439 515 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 SLC10A1Q14973 349 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 RTP5Q14D33 572 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 TGIF1Q15583 401 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ODF4Q2M2E3 257 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 PLA1AQ53H76 456 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 PGAP1Q75T13 922 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 DOK3Q7L591 496 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF627Q7L945 461 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 LINGO2Q7L985 606 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ITFG2Q969R8 447 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 C10orf35Q96D05 121 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 GP6Q9HCN6 339 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 DIABLOQ9NR28 239 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 EMC3Q9P0I2 261 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 CACNG2Q9Y698 323 aa7.28□□□□□ -1.24
ATXN3-235ENST00000556082 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FREM3P0C091 2139 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 A0A1B0GVC2 190 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 A6NIN4 97 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ARGFXA6NJG6 315 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PROB1E7EW31 1015 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ACOT7O00154 380 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ORC5O43913 435 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SYNGR4O95473 234 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 F10P00742 488 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ADRB1P08588 477 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GSTT2BP0CG30 244 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GABRA1P14867 456 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 RAB3AP20336 220 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 BDKRB2P30411 391 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GDNFP39905 211 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MAGEA5P43359 124 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 CX3CR1P49238 355 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 POU3F4P49335 361 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 MEOX1P50221 254 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TNFSF10P50591 281 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 CLDN12P56749 244 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TAS2R20P59543 309 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PCBD1P61457 104 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 DGCR2P98153 550 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 PLGLB1Q02325 96 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 RAB35Q15286 201 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 ZNF124Q15973 351 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 LUZP2Q86TE4 346 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 AKAP14Q86UN6 197 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SIAH3Q8IW03 269 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 SPTSSAQ969W0 71 aa7.27□□□□□ -1.25
ATXN3-235ENST00000556082 FGGYQ96C11 551 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.3 ms