RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B6O14756 317 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 XRCC3O43542 346 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 CLDN20P56880 219 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 OR6X1Q8NH79 312 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.66□□□□□ -1.18
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