RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.16□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADA2Q9NZK5 511 aa8.16□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.16□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AURKCQ9UQB9 309 aa8.16□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.16□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GWJ7 208 aa8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GMNCA6NCL1 334 aa8.15□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD2P08910 425 aa8.15□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFB7P17568 137 aa8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMYD1Q8NB12 490 aa8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.15□□□□□ -1.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT19A8MXV4 375 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RER1O15258 196 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPLP06858 475 aa8.14□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF613Q6PF04 617 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT73Q86Y46 540 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PFN4Q8NHR9 129 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC29Q8WV35 223 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB18Q99592 522 aa8.14□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.14□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RMND5AQ9H871 391 aa8.14□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.14□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITM2AO43736 263 aa8.13□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYPD3O95274 346 aa8.13□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LBPP18428 481 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMY2BP19961 511 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSX2Q16385 188 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGAP1Q75T13 922 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.13□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.13□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7A10O76100 309 aa8.12□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TGM4P49221 684 aa8.12□□□□□ -1.11
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK6Q00534 326 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP6Q13520 282 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DGUOKQ16854 277 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG10Q5BKT4 473 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REEP3Q6NUK4 255 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF329Q86UD4 541 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAA40Q86UY6 237 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.12□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD300LBA8K4G0 201 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F5H5K5 113 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLIC1O00299 241 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A17O43808 307 aa8.11□□□□□ -1.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GMDSO60547 372 aa8.11□□□□□ -1.11
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