RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494333.1

RIF1-211, Transcript of replication timing regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RIF1, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1-211ENST00000494333 GPA33Q99795 319 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 FUZQ9BT04 418 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 WACQ9BTA9 647 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NUAK2Q9H093 628 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TREM2Q9NZC2 230 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RTTNQ86VV8 2226 aa6.86□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 B4DSR2 109 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ARPC2O15144 300 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SGCEO43556 437 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 DOK2O60496 412 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RP2O75695 350 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PPP1R3DO95685 299 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SLPIP03973 132 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SEMG1P04279 462 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 FABP3P05413 133 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 HKR1P10072 659 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 COX5BP10606 129 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RRM2P31350 389 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 HTR5AP47898 357 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 MMP15P51511 669 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 MNAT1P51948 309 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ARHGDIAP52565 204 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CDH15P55291 814 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 HFEQ30201 348 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RFX4Q33E94 735 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 AVPI1Q5T686 147 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ADCK1Q86TW2 530 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CCL17Q92583 94 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TSSK2Q96PF2 358 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 OR52D1Q9H346 318 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NDE1Q9NXR1 346 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.85□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 FAM157AC9JC47 383 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 F5H697 171 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 DCTN6O00399 190 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 RER1O15258 196 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TXNDC12O95881 172 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IGHV1-46P01743 117 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PEX2P28328 305 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CRABP1P29762 137 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SLC6A6P31641 620 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IFNGR2P38484 337 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LIPAP38571 399 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LMO4P61968 165 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 BLOC1S1P78537 153 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 PSG7Q13046 419 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 AQP6Q13520 282 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 MEP1BQ16820 701 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LEG1Q6P5S2 330 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LNX2Q8N448 690 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 OR4K13Q8NH42 304 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SLC7A6Q92536 515 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NSL1Q96IY1 281 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 SAMD8Q96LT4 415 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 NMNAT3Q96T66 252 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 IFT27Q9BW83 186 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 B9D1Q9UPM9 204 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 STARD10Q9Y365 291 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 CACNG2Q9Y698 323 aa6.84□□□□□ -1.31
RIF1-211ENST00000494333 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RIF1-211ENST00000494333 CLDN25C9JDP6 229 aa6.83□□□□□ -1.32
RIF1-211ENST00000494333 H3BSA7 217 aa6.83□□□□□ -1.32
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