RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 TAF13Q15543 124 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 OR52N1Q8NH53 320 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 LINC01560Q8TB33 94 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 ZNF221Q9UK13 617 aa14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 PNPP00491 289 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 CRYBB2P43320 205 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 ZNF544Q6NX49 715 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 SETD6Q8TBK2 473 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 MUCL1Q96DR8 90 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 BRD7Q9NPI1 651 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 STUB1Q9UNE7 303 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.65□□□□□ -0.06
NF1-211ENST00000487476 RGS13O14921 159 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 MT-ND5P03915 603 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SERPINA5P05154 406 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SLC2A1P11166 492 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 CBR1P16152 277 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 CCNOP22674 350 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 CRYGSP22914 178 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 STOMP27105 288 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 TGM4P49221 684 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ZNF83P51522 516 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 GPR50Q13585 617 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ZNF79Q15937 498 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 UTS2BQ765I0 119 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SYS1Q8N2H4 156 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 WACQ9BTA9 647 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 TENM4Q6N022 2769 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 C5orf49A4QMS7 147 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 C5orf63A6NC05 138 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 WIPF3A6NGB9 483 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 IGKV3-15P01624 115 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 S100A1P23297 94 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 RORCP51449 518 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 PLP2Q04941 152 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.64□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 C19orf84I3L1E1 186 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 HSD11B1P28845 292 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 RFX2P48378 723 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 BAK1Q16611 211 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 NDUFA5Q16718 116 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 COQ7Q99807 217 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 MED18Q9BUE0 208 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 CX3CR1P49238 355 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 WDFY2Q96P53 400 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 KCNJ15Q99712 375 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SRRQ9GZT4 340 aa14.63□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 M0R135 149 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 M0R1B8 84 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ZNF254O75437 659 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 IGLV1-44P01699 117 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 TACSTD2P09758 323 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 CECR9P0C854 216 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 IL7P13232 177 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 PHC2Q8IXK0 858 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 ZNF799Q96GE5 643 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.62□□□□□ -0.07
NF1-211ENST00000487476 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms