RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 AIM2O14862 343 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SLIT1O75093 1534 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 FUT5Q11128 374 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 FMN1Q68DA7 1419 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CHST4Q8NCG5 386 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 USP47Q96K76 1375 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RSG1Q9BU20 258 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RREB1Q92766 1687 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SMKR1H3BMG3 65 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SEMA3DO95025 777 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 NDUFB10O96000 172 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ATF6P18850 670 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CDH6P55285 790 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 GFERP55789 205 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 TMEM104Q8NE00 496 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CLIP1P30622 1438 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 TMEM2Q9UHN6 1383 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ZNF24P17028 368 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 BAMBIQ13145 260 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R7Q15435 360 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 TAF9Q16594 264 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 GUSBP11Q6P575 273 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CERS6Q6ZMG9 384 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 COL21A1Q96P44 957 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ERVK-7P63135 1459 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 CASZ1Q86V15 1759 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 LYRM9A8MSI8 78 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ARG1P05089 322 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 P0C880 135 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ZNF266Q14584 549 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ZNF101Q8IZC7 436 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 TET3O43151 1660 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 PREX2Q70Z35 1606 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SLIT2O94813 1529 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.03□□□□□ -1.92
SGCE-210ENST00000472326 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 OR5H1A6NKK0 313 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 C16orf90A8MZG2 172 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 K7EMT4 169 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CLOCKO15516 846 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ACTR3P61158 418 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SP4Q02446 784 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SSX2Q16385 188 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 GPR26Q8NDV2 337 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 NUBPLQ8TB37 319 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 WDR34Q96EX3 536 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 IP6K3Q96PC2 410 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 CENPKQ9BS16 269 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.02□□□□□ -1.93
SGCE-210ENST00000472326 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.02□□□□□ -1.93
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