RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 ZNF878C9JN71 531 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 RAB27BO00194 218 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 GABRA1P14867 456 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 IFI44Q8TCB0 444 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 COMMD9Q9P000 198 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 TSPAN9O75954 239 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NAGAP17050 411 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 CD96P40200 585 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PTGDSP41222 190 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 IL13RA1P78552 427 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ARFRP1Q13795 201 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 OR2M3Q8NG83 312 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 TTC9Q92623 222 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 UCN2Q96RP3 112 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 C5orf51A6NDU8 294 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 STK17BO94768 372 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PMS2P2O95744 297 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ITGB2P05107 769 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ISG15P05161 165 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PGA4P0DJD7 388 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PGA3P0DJD8 388 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 BAMBIQ13145 260 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PPP1R1AQ13522 171 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PGAM5Q96HS1 289 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 CST11Q9H112 138 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.49□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 FAM186AA6NE01 2351 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SIGLEC5O15389 551 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SOCS1O15524 211 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 RRASP10301 218 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 CAPZA1P52907 286 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 HTR3BO95264 441 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.48□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 RLN2P04090 185 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 CCL3P10147 92 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NPY4RP50391 375 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 OR5H14A6NHG9 310 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 CHAF1BQ13112 559 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SAP25Q8TEE9 199 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 U3KQA8 63 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NCOR1O75376 2440 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 OR5H15A6NDH6 313 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 TP53I11O14683 189 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 TSPAN4O14817 238 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 LINC00052Q96N35 136 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 DKKL1Q9UK85 242 aa14.47□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 E9PLN8 166 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 DBHP09172 617 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF735P0CB33 412 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 SERPINA2P20848 420 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 OR4K15Q8NH41 348 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.46□□□□□ -0.09
SLX4-202ENST00000466154 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms