RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 RRM2BQ7LG56 351 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 PRRC1Q96M27 445 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 C7orf26Q96N11 449 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 PITX2Q99697 317 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 SLC22A4Q9H015 551 aa11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CENPF-202ENST00000464322 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GGT3PA6NGU5 568 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SOCS2O14508 198 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MPIG6BO95866 241 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GGT2P36268 569 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PRKCDQ05655 676 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ECH1Q13011 328 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 TRAM2Q15035 370 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 LY6EQ16553 131 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MEP1BQ16820 701 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ZBED5Q49AG3 693 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SH3GL1Q99961 368 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NUAK2Q9H093 628 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.7□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 A0A1B0GWJ7 208 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CD300LBA8K4G0 201 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 IMPA2O14732 288 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GZMMP51124 257 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 DLX1P56177 255 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 KLRD1Q13241 179 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 FHL1Q13642 323 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MICBQ29980 383 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 RABL3Q5HYI8 236 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 C11orf88Q6PI97 169 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NAA40Q86UY6 237 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 LNX2Q8N448 690 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 R3HDM4Q96D70 268 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CCL13Q99616 98 aa11.69□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 H3BUX3 64 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GMDSO60547 372 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ACSM4P0C7M7 580 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 KIR2DS4P43632 304 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 EFNB2P52799 333 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MZT1Q08AG7 82 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 IKZF1Q13422 519 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 FGFRL1Q8N441 504 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PNKDQ8N490 385 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 PHF21AQ96BD5 680 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 TSSK2Q96PF2 358 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SSX3Q99909 188 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 FAM234AQ9H0X4 552 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.68□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 J3KTA2 159 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CDC42EP2O14613 210 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NDUFB3O43676 98 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 NDUFB2O95178 105 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 CRABP1P29762 137 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SDHAP31040 664 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SAA4P35542 130 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 TPTEP56180 551 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 KCNMB1Q16558 191 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 FAM122BQ7Z309 247 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.67□□□□□ -0.54
CENPF-202ENST00000464322 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms