RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ARSBP15848 533 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAB6AP20340 208 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CCL1P22362 96 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CDK2P24941 298 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CD96P40200 585 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 POU3F4P49335 361 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CLDN12P56749 244 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TAS2R20P59543 309 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CD300CQ08708 224 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ECH1Q13011 328 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CBX3Q13185 183 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MADCAM1Q13477 382 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 STK11Q15831 433 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ODF4Q2M2E3 257 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FAM27BQ5VT28 67 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CARD17Q5XLA6 110 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAB12Q6IQ22 244 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CORO6Q6QEF8 472 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DOK3Q7L591 496 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR56B4Q8NH76 319 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A28Q96A46 364 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 UPRTQ96BW1 309 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ADGRG7Q96K78 797 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ING3Q9NXR8 418 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 C7orf66A4D0T2 115 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GGT3PA6NGU5 568 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 A6NL46 340 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 G3V3Y1 287 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 P2RY10O00398 339 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 PRAF2O60831 178 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 CTAG2O75638 210 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC6AO75865 159 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 RBBP9O75884 186 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ALX3O95076 343 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 WNT11O96014 354 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ALDOBP05062 364 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ITGA5P08648 1049 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 CSF1P09603 554 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GABRA1P14867 456 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 RAB3AP20336 220 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GDF1P27539 372 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 BDKRB2P30411 391 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 BTCP35070 178 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GSK3AP49840 483 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GFRA1P56159 465 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 SOX8P57073 446 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 FOXO1Q12778 655 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 MFAP5Q13361 173 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 BCL2A1Q16548 175 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 CARTPTQ16568 116 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 SGCAQ16586 387 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 NRN1LQ496H8 165 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP69Q49AA0 526 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 OTPQ5XKR4 325 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF529Q6P280 563 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 GGNQ86UU5 652 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 LYPD6Q86Y78 171 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM45BQ96B21 275 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms