RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGAP1Q75T13 922 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01006Q8NI28 216 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCN3Q96D15 328 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDFY2Q96P53 400 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF6BQ99941 703 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM15Q9C019 465 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FN3KRPQ9HA64 309 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B9D1Q9UPM9 204 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.91□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PRQ8 180 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM20O43506 726 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLPXO76031 633 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R3DO95685 299 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-69P01742 117 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-59P01825 116 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCATP04180 440 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECH1Q13011 328 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGCR6Q14129 220 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8G1Q15617 311 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGD3Q5JSP0 725 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC26A10Q8NG04 563 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHX4Q969G2 390 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITX2Q99697 317 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A4Q9H015 551 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRPDQ9H106 197 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AURKCQ9UQB9 309 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN7Q9Y6W3 813 aa10.9□□□□□ -0.66
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC119BA6NIH7 251 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTA4O15217 222 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA6P23280 308 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROK1P58294 105 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8B8Q15620 311 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF9Q16594 264 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA40Q86UY6 237 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6V1Q8N148 313 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.89□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0U1RQK1 487 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OOEPA6NGQ2 149 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD300LBA8K4G0 201 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NME4O00746 187 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA2O43678 99 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IER3P46695 156 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A2P52569 658 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC23BQ15437 767 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC36A3Q495N2 470 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGB2Q6NT52 195 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANK1Q8TC84 345 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM162AQ96A26 154 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMNAT3Q96T66 252 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.88□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R135 149 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A2O15244 555 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX3O60493 162 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GMDSO60547 372 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN15O95858 294 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RENP00797 406 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHCEP18577 417 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGT2P36268 569 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSK3BP49841 420 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPTEP56180 551 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARF6P62330 175 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms