RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRPO00591 440 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRCC2O43543 280 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX5O75715 221 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABARAPO95166 117 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATE1O95260 518 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OCM2P0CE71 109 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM3P62310 102 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13C5Q8NGS8 318 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 THRSPQ92748 146 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISOC1Q96CN7 298 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL7BQ9BQE9 202 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGCCQ9H4X1 137 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR84Q9NQS5 396 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF391Q9UJN7 358 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRYAAP02489 173 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 C22orf34Q6ZV56 151 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM19Q7Z692 300 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13C3Q8NGS6 347 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QW42 95 aa23.73■■□□□ 1.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF12P17014 697 aa23.73■■□□□ 1.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRNP28799 593 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT5AP41221 380 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAAAQ02083 359 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q499Y3 187 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOK3Q7L591 496 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 REEP6Q96HR9 211 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51B6Q9H340 312 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBAL3A6NHL2 446 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF879B4DU55 563 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD2P06729 351 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 THBDP07204 575 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF35P13682 527 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCSK6P29122 969 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX2P48431 317 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFF3Q07654 80 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLYATL3Q5SZD4 288 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 C22orf42Q6IC83 251 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10AC1Q8NH08 325 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGK3Q96BR1 496 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14A2Q96R54 314 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf63A6NC05 138 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTAFRP25105 342 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD52P43351 418 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSL4Q14641 139 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMAT1Q5H9K5 638 aa23.71■■□□□ 1.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51A4Q8NGJ6 313 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2AE1Q8NHA4 323 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NGFP01138 241 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM157BP0CG42 384 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 UCP2P55851 309 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTF1Q16619 201 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF101Q8IZC7 436 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01560Q8TB33 94 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHYHIPQ92561 330 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD7Q96MP8 289 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPOQ9BU64 300 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 STARD10Q9Y365 291 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GTI1 187 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SMPD2O60906 423 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL6IP5O75915 188 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANOS1P23352 680 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD40P25942 277 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX19P40855 299 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 VBP1P61758 197 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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