RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 AKR1C1Q04828 323 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TOMM20Q15388 145 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SLC6A19Q695T7 634 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ARL9Q6T311 187 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TEX19Q8NA77 164 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR52I2Q8NH67 350 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TAAR8Q969N4 342 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 UBQLN3Q9H347 655 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GJE1A6NN92 205 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GABARAPH6UMI1 98 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SURF4O15260 269 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 BGLAPP02818 100 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GDF1P27539 372 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ATP6V1E1P36543 226 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MEOX1P50221 254 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PRPS1P60891 318 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PLGLB1Q02325 96 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SMCO1Q147U7 214 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TRAM1Q15629 374 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RAET1LQ5VY80 246 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 LINGO2Q7L985 606 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MNTQ99583 582 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR52D1Q9H346 318 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 KLK11Q9UBX7 282 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PINLYPA6NC86 204 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 E9PI62 339 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ACOT7O00154 380 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TRAPPC6AO75865 159 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 HPNP05981 417 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 BDKRB2P30411 391 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SLC6A6P31641 620 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 BLOC1S1P78537 153 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 SORDQ00796 357 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MPPED2Q15777 294 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 NAA40Q86UY6 237 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ALG8Q9BVK2 526 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 HES7Q9BYE0 225 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RAXQ9Y2V3 346 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MPDZO75970 2070 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 USP24Q9UPU5 2620 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 A0A0D9SG52 128 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 UBE2QL1A1L167 161 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 GOSR2O14653 212 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 EFNA2O43921 213 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 NDUFB2O95178 105 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ASAH2BP0C7U1 165 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ZNF44P15621 663 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 ABOP16442 354 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 RAC1P63000 192 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 TEX30Q5JUR7 227 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-201ENST00000318129 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.1 ms